In Sachen Fußball ist der 1. FC Neubrandenburg 04 der Partner des Neubrandenburger Sportgymnasiums. In der Eliteschule des Sports sind stets mehr als 100 Mädchen und Jungen dabei, die beim größten Fußballverein der Region leistungsorientiert Fußball spielen. Sie kommen aus Neubrandenburg und Umgebung sowie aus dem gesamten Nordosten und sind so zum Teil im Sportinternat untergebracht. Das Früh- und Nachmittagstraining wird durch den 1. FC Neubrandenburg 04 abgesichert.
Die Zusammenarbeit zwischen Sportgymnasium und 1. FCN 04 (bzw dessen Vorgängervereine) hat in der Vergangenheit zahlreiche Talente hervorgebracht – Spielerinnen und Spieler, die später auch höherklassig auf sich aufmerksam machten und denen sogar den Sprung in die Nationalmannschaft gelang – so Nationalspieler Tim Borowski (SV Werder Bremen und Bayern München, WM-Dritter 2006) und Viola Odebrecht (u.a. Weltmeisterin 2003 und dreifache Championsleague-Gewinnerin mit Turbine Potsdam). In ihren Fußstapfen derzeit Lina Jubel (U17-Nationalspielerin).
